Seit 2009 gehörte Martin Schönenberger dem Verwaltungsrat der FC St.Gallen Event AG und der FC St.Gallen AG an. Im September teilte er mit, dass er sich 2018 keiner Wiederwahl mehr stellen werde. Schönenbergers Rücktritt steht in Zusammenhang mit den Abgängen von Verwaltungsrats-Vizepräsident Michael Hüppi und CEO Pascal Kesseli. Der engagierte Schönenberger bleibt aber Präsident der Sponsorenvereinigung DienstagsClub sowie Präsident des Organisationskomitees der Nacht des Ostschweizer Fussballs. Unternehmerisch ist der 66-jährige St.Galler als Inhaber und VRPräsident der PMS Schönenberger AG aktiv.